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AI制藥離患者還有多遠?可能每個環(huán)節(jié)都需要一個大模型
來源:互聯(lián)網(wǎng)   發(fā)布日期:2025-01-08 08:59:18   瀏覽:241次  

導讀:馮葉使用AI工具生成/圖。談及新藥研發(fā),“雙十定律”是常被提起的關(guān)鍵詞,意在表達創(chuàng)新藥從研發(fā)到上市面臨的路程之艱:平均研發(fā)成本超過十億美元、研發(fā)周期通常大于十年。而人工智能(AI)的崛起有望打破這一定律。據(jù)海通證券研報,AI制藥是以醫(yī)藥大數(shù)據(jù)為基礎,通過運用機器學習、深度學習等AI技術(shù)模擬和加速實驗,對藥物靶點、結(jié)構(gòu)、化合物等進行快速分析,以優(yōu)化藥物研發(fā)環(huán) ......

AI制藥離患者還有多遠?可能每個環(huán)節(jié)都需要一個大模型

馮葉使用AI工具生成/圖。

談及新藥研發(fā),“雙十定律”是常被提起的關(guān)鍵詞,意在表達創(chuàng)新藥從研發(fā)到上市面臨的路程之艱:平均研發(fā)成本超過十億美元、研發(fā)周期通常大于十年。

而人工智能(AI)的崛起有望打破這一定律。據(jù)海通證券研報,AI制藥是以醫(yī)藥大數(shù)據(jù)為基礎,通過運用機器學習、深度學習等AI技術(shù)模擬和加速實驗,對藥物靶點、結(jié)構(gòu)、化合物等進行快速分析,以優(yōu)化藥物研發(fā)環(huán)節(jié)的技術(shù)手段。

2020年,谷歌(NASDAQ: GOOG, GOOGL)旗下DeepMind公司發(fā)布的AI系統(tǒng)AlphaFold 2因能準確地預測蛋白質(zhì)的3D結(jié)構(gòu),點燃人們對AI驅(qū)動藥物研發(fā)的熱情,在新冠疫情對醫(yī)藥行業(yè)的催化下,AI制藥一時入局者眾。

如今近四年時間過去,實際情況卻難言理想。全球范圍內(nèi)鮮有所謂的AI制藥企業(yè)實現(xiàn)盈利;頂著國內(nèi)“AI制藥第一股”光環(huán)的晶泰科技(2228.HK)登陸港交所后屢屢破發(fā);兩家在納斯達克上市的AI制藥龍頭公司Recursion(NASDAQ:RXRX)和Exscientia(NASDAQ:EXAI)宣布合并,被市場認為是“抱團取暖”。

進入2024年,一些昔日明星初創(chuàng)AI制藥企業(yè)被傳清算,不少公司在破產(chǎn)邊緣徘徊。市場上也仍未出現(xiàn)由AI設計的藥物。

AI制藥究竟遇到了什么麻煩?真正由AI設計的藥物離患者還有多遠?

“跑出來的寥寥無幾”

藥物研發(fā)過程通?梢苑譃樗膫環(huán)節(jié):藥物發(fā)現(xiàn),包括動物實驗在內(nèi)的臨床前研究,在人體進行Ⅰ期到Ⅲ期臨床實驗,最后是新藥申請。當前AI制藥大都針對藥物發(fā)現(xiàn)和臨床前研究。

蔡誠是一家上市藥企的計算藥物科學家,他告訴南方周末,AI在藥物發(fā)現(xiàn)和臨床前研究環(huán)節(jié)有兩大重要任務:選擇正確的靶點,找到針對該靶點的臨床前候選分子。

其中,找到正確的靶點是整個藥物研發(fā)的第一步,對整個新藥研發(fā)項目起到?jīng)Q定性作用。

如果把疾病比作一把鎖,那么靶點即鎖芯,如果能夠找到鎖芯,研究出鎖芯的立體結(jié)構(gòu),那么就可以為其配備一把專有鑰匙新藥。

臨床前候選分子,指的是已完成動物實驗等環(huán)節(jié),等待在人體進行臨床試驗的藥物分子!癆I被認為能讓這兩個環(huán)節(jié)加速、提效!辈陶\說。

華創(chuàng)證券分析師援引波士頓咨詢公司(BCG)統(tǒng)計研究報告數(shù)據(jù)指出,過去10年,AI發(fā)現(xiàn)的藥物分子臨床試驗數(shù)量增長迅速,年復合增速超過60%,但目前大部分還停留在臨床Ⅰ期。

上述數(shù)據(jù)還顯示,截至2023年12月24日,共有24個AI發(fā)現(xiàn)藥物分子完成Ⅰ期臨床,21項成功,成功率遠高于40%-65%的行業(yè)歷史平均水平;共有10個AI發(fā)現(xiàn)藥物分子完成Ⅱ期臨床,4項成功,持平/略高于行業(yè)30%-40%的歷史平均水平。

如果保持上述臨床Ⅰ/Ⅱ期成功率并假設AI制藥Ⅲ期成功率與行業(yè)歷史平均水平一致,那么新藥研發(fā)全臨床端到端成功率將從5%-10%提升至9%-18%,幾乎翻倍。

然而,即便是翻倍,新藥研發(fā)的成功仍然是小概率事件。自2023年開始,就有消息稱海外AI制藥企業(yè)部分管線受挫、停止研發(fā),如被合并前在納斯達克上市的Exscientia為強迫癥病人所開發(fā)的治療藥物DSP-1181,其因是全球首個進入臨床的AI新藥而備受關(guān)注。

“現(xiàn)狀確實是這樣,第一批資本投的企業(yè)跑出來的寥寥無幾!标惓瘜δ戏街苣┱f。他是一家2020年成立的AI制藥企業(yè)的聯(lián)合創(chuàng)始人。

在陳朝看來,2020年的AI制藥熱潮并非技術(shù)進步之后的自然結(jié)果,而是由疫情刺激下的投資浪潮帶來的。當熱潮退去,行業(yè)整合、部分玩家退出是自然而然的事。

2018年,香港聯(lián)合交易所《主板上市規(guī)則》第18A章引入“生物科技公司”;2019年上海證券交易所科創(chuàng)板推出,降低了生物科技企業(yè)的上市要求,允許符合條件的創(chuàng)新企業(yè)上市時不受盈利門檻限制。資本對醫(yī)藥行業(yè)的追逐開始升溫,2020年的新冠疫情讓這一追逐達到巔峰。

但2021年成為轉(zhuǎn)折之年。醫(yī)藥企業(yè)在二級市場的募資額連續(xù)下降,相關(guān)概念股股價受挫。二級市場的“寒意”傳導至一級市場,初創(chuàng)企業(yè)遭遇融資難,資本寒冬成為行業(yè)活動和論壇上的關(guān)鍵詞。

AI制藥也未能例外,初創(chuàng)企業(yè)被迫節(jié)衣縮食、加快“自證”步伐。

商業(yè)模式尚未跑通

晶泰科技是幸運的。在2024年6月上市之前,晶泰科技完成了8輪融資,累計融資額接近8億美元。

據(jù)晶泰科技披露的最新財務數(shù)據(jù),2024年上半年,公司實現(xiàn)營收1.03億元,同比增加28.34%,經(jīng)營虧損達到3.93億元,虧損幅度同比有所收窄。同期晶泰科技發(fā)生研發(fā)開支2.1億元,約是其同期營收的2倍,成為虧損的重要原因。

不只是晶泰科技,英矽智能同樣面臨持續(xù)大額虧損的境遇。其在2023年實現(xiàn)營收5118萬美元,同比增加69.77%,歸母凈利潤虧損2.12億美元,虧損幅度同比收窄約5%。

這背后是AI制藥行業(yè)的一大困境商業(yè)模式尚不清晰。

“AI無論在任何方面都是一個工具,其實是為了解決問題,但現(xiàn)在實際情況是AI只解決了部分問題,沒辦法一下帶來非常大的幫助,所以商業(yè)化可能有些不順!痹贏I制藥企業(yè)和大型藥企從事研發(fā)工作的羅新告訴南方周末。

在晶泰科技的官方介紹中,公司創(chuàng)立于2015年,其將自身定位為基于量子物理、以人工智能賦能和機器人驅(qū)動的創(chuàng)新型研發(fā)平臺,主要業(yè)務包括藥物發(fā)現(xiàn)解決方案以及固態(tài)研發(fā)服務及自動化化學合成服務。

市場將晶泰科技視為目前AI制藥行業(yè)三大主流商業(yè)模式中“AI+CRO”的代表,CRO通俗來說即醫(yī)藥研發(fā)外包。晶泰科技承接下游客戶訂單后,完成約定的研發(fā)環(huán)節(jié)并確認收入。

然而這部分收入較為有限。華創(chuàng)證券分析師指出,目前AI制藥未有商業(yè)化產(chǎn)品上市,客戶還在探索嘗試階段,投入不會很大,外包給“AI+CRO”企業(yè)的訂單金額相對有限。

2024年諾貝爾化學獎得主John Jumper的同門師弟、芝加哥大學計算化學博士王宗安曾撰文指出,從藥物研發(fā)全流程看,目前AI能觸及的環(huán)節(jié)很少,相應外包業(yè)務的總體量并不大。

晶泰科技并非全部依賴藥物發(fā)現(xiàn)環(huán)節(jié)的服務創(chuàng)收。晶泰科技2024年中報顯示,上半年其1.03億元的營收中有六成來自藥物發(fā)現(xiàn)解決方案,另外四成來自固態(tài)研發(fā)服務及自動化化學合成服務,其中固態(tài)研發(fā)服務是晶泰科技的起家業(yè)務。但有兩位受訪者提到,這部分業(yè)務使用到的技術(shù)事實上是計算物理范疇,與AI關(guān)系不大。

英矽智能是中國另一AI制藥龍頭企業(yè),目前已兩度遞表港交所求IPO,但尚未成功。英矽智能因上手做藥,被視為另一主流模式“AI+biotech”的代表。然而新藥研發(fā)周期本就很長,其自研藥物進展最快的是一款治療致命罕見病特發(fā)性肺纖維化的藥物ISM001-055,目前處于臨床Ⅱ期研究階段。

目前英矽智能依靠將自行開發(fā)的藥物管線進行對外授權(quán)創(chuàng)收。據(jù)英矽智能招股書,2023年英矽智能的5118萬美元收入中,有3902萬美元來自于管線藥物開發(fā),這來自于自英矽智能2023年向Exelixis授出許可ISM3091在全球范圍內(nèi)的研究、開發(fā)、制造及商業(yè)化的權(quán)利的收入。

對于這一模式,英矽智能聯(lián)席CEO任峰曾表示,“我們現(xiàn)在看著有希望可以跑通,至少可以把收入做大!

主流的第三種商業(yè)模式是“AI+SaaS”,主要提供AI輔助藥物開發(fā)軟件服務平臺,例如納斯達克上市公司薛定諤(NASDAQ:SDRG)。薛定諤被認為是全球范圍內(nèi)首家盈利的AI制藥公司,其在2023年曾因獲得其投資的公司的現(xiàn)金分配實現(xiàn)盈利,但在2024年前三季度再次出現(xiàn)虧損。

“在收入比較高的情況下又能實現(xiàn)盈利,這是商業(yè)模式跑通的一個共識,但薛定諤不算!比畏甯嬖V南方周末,薛定諤的業(yè)務以軟件銷售為主,但并非2023年盈利來源。同時他認為,軟件銷售模式的天花板較低,維護成本很高,很難實現(xiàn)盈利。

缺乏質(zhì)量數(shù)據(jù)

多位受訪者稱,行業(yè)發(fā)展當前面臨的一個困境是,AI解決問題的能力沒有想象中強,目前多為輔助作用。

“不只中國,世界范圍內(nèi)(AI制藥)都沒有特別成熟!辈陶\以大部分AI制藥企業(yè)聚焦的小分子藥物舉例,“就找到臨床前候選分子而言,AI大部分時候沒辦法從零開始生成、優(yōu)化想要的小分子。項目起點更多還是依賴(人工)實驗篩選,然后在優(yōu)化的過程中AI有一點幫助!

如前述提到的,除了找到臨床前候選分子外,發(fā)現(xiàn)新靶點也是藥物研發(fā)的一大難點。

在這方面,蔡誠表示AI確實能做一些工作,但需要承認,靶點發(fā)現(xiàn)本身是一件非常難的事,AI幾乎還沒有成功案例。一個業(yè)內(nèi)受到廣泛關(guān)注的例子是上述英矽智能正在推進的新藥ISM001-055,進度屬于業(yè)內(nèi)領先。

在英矽智能官方的介紹中,這款藥物是“全球首款真正由AI發(fā)現(xiàn)新穎靶點、AI設計創(chuàng)新分子結(jié)構(gòu)的‘AI藥物’!薄澳艹晒Φ脑挷艜懈嗳巳ジM!辈陶\說。

由此來看,AI目前更多在藥物發(fā)現(xiàn)階段起到輔助作用,雖然確實縮短了藥物發(fā)現(xiàn)的時間,但這些環(huán)節(jié)在新藥研發(fā)的漫長周期中占比有限。

王宗安告訴南方周末,整個新藥研發(fā)流程中,進入臨床試驗之前的環(huán)節(jié)一般需要2年到5年。占據(jù)最長時間的是臨床試驗,特別是Ⅲ期臨床,Ⅰ期到Ⅲ期臨床試驗總共平均需要約10年,目前這部分時間很難壓縮。

李春在某頭部AI制藥企業(yè)從事研發(fā)工作,他擁有人工智能輔助藥物研發(fā)、計算生物等多個領域復合背景,他從數(shù)據(jù)角度向南方周末解釋了為何AI能解決的問題很有限。

“數(shù)據(jù)、算法和算力是AI的三大支柱,數(shù)據(jù)質(zhì)量和AI 預測的準確性密切相關(guān)。”李春說,AI制藥企業(yè)常根據(jù)論文等開源數(shù)據(jù)開發(fā)模型,然后迅速接藥企的訂單、去做預測工作。“開源的數(shù)據(jù)多半是研究透了的常見靶點,但藥企要做的項目靶點數(shù)據(jù)很少,沒有數(shù)據(jù)讓AI學,那么預測就不準!

“這些AI制藥公司完全有能力自己做數(shù)據(jù),以此更好的開發(fā)模型,但它們非常著急,沒有意愿投入更多的時間和資源。算法層面,大家傾向于直接用或者是一次開發(fā),沒有在多個數(shù)據(jù)上面進行持續(xù)迭代改進算法。”李春表示,“可能是因為被資本推著往前走,需要上市或者盈利,就沒有耐心!

另外,新藥研發(fā)中,臨床前研究這一階段的數(shù)據(jù)難以獲得。臨床前研究包括在動物身上做實驗,一只猴子要花幾萬元,考慮到AI需要的數(shù)據(jù)量,可能需要幾千只猴子!皩嶒炞霾黄穑瑪(shù)據(jù)就比較少,影響AI的預測和模型開發(fā)。”更別提臨床階段,在人體身上需要的數(shù)據(jù),就更加難以獲得。

據(jù)蔡誠介紹,行業(yè)正在努力突破限制,例如嘗試通過物理模擬輸出數(shù)據(jù)來反哺AI訓練,另外現(xiàn)在也有一些實驗方法可以產(chǎn)生海量數(shù)據(jù)。

人才與時間

導致AI制藥企業(yè)虧損的一大原因是高企的研發(fā)開支,人力成本是其中最重要的組成部分。

晶泰科技2024年中報顯示,其上半年2.1億元的研發(fā)開支中,人力成本近1.15億元,占比過半,遠超折舊、材料等其他細分研發(fā)開支項。英矽智能因開發(fā)自有管線,其用于管線開發(fā)的研發(fā)外包支出在研發(fā)開支的占比最大,達六成;人力成本位列第二,占比近三成。

多位受訪者表示,國內(nèi)AI制藥企業(yè)的發(fā)展仍因人才受限!皣鴥(nèi)基礎研究不足,國外研究成果出來了,國內(nèi)公司才開始照搬,但是招人的時候發(fā)現(xiàn)沒有相關(guān)經(jīng)驗。目前是有突破,但是還不夠!

在王宗安看來,國內(nèi)企業(yè)招攬人才時“愿意付的工資太少”。據(jù)他了解,在谷歌DeepMind公司,100萬英鎊的總包年薪對一個符合要求的前沿領域博士畢業(yè)生而言,并不是一個夸張的數(shù)字,而國內(nèi)頂尖大學的博士畢業(yè)生,入職知名互聯(lián)網(wǎng)頭部企業(yè)或科技公司,年薪可能在幾十萬或一百萬元人民幣左右。

“其實國內(nèi)企業(yè)并不是付不起這個工資,而是沒有把錢花在刀刃上。”王宗安說,國外有很多華人年輕學者,不用給到七八百萬,可能給兩百萬他們就回來了,“但問題是,兩百萬比國內(nèi)一些CEO拿的還多!

另一個與“人”有關(guān)的細節(jié)是,有受訪者提到,部分AI制藥企業(yè)存在“人事沖突”,做AI的和做實驗的融合起來比較難,“可能關(guān)系到利益分配,比如AI幫忙做了原本實驗要做的事”。

除了人才,時間亦是重要維度。

2024年上半年,谷歌旗下DeepMind公司開發(fā)的AI系統(tǒng)AlphaFold 3發(fā)布。同期,位于舊金山的AI制藥初創(chuàng)公司Xaira Therapeutics拿下超十億美元種子輪融資,該公司主要研究蛋白質(zhì)如何在健康和疾病中發(fā)生變化,公司聯(lián)合創(chuàng)始人David Baker數(shù)月后因“計算蛋白質(zhì)設計”獲得諾貝爾化學獎,同時獲獎的還有被譽為“AlphaFold之父”的Demis Hassabis和John Jumper。

這為AI制藥帶來新的方向“AI+蛋白質(zhì)”。王宗安解釋,“我們可以粗略地理解,藥物分子結(jié)合到靶點上后,會使蛋白質(zhì)發(fā)生一定的結(jié)構(gòu)變化,導致后續(xù)的功能變化,最終反映到臨床上會影響病癥的表現(xiàn)。因此從微觀上說,制藥的起點是蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)!

“但是蛋白質(zhì)和最終的臨床治療,二者間隔得實在太遙遠了!蓖踝诎蔡岬,上述諾獎獲得者Demis Hassabis曾表示,如果想要讓AI真正在制藥上發(fā)揮作用,還需要若干個像AlphaFold這樣級別的發(fā)現(xiàn),AlphaFold只是“拼圖中的一塊”。“在制藥一連串鏈條上,每個環(huán)節(jié)可能都得有一個類似于AlphaFold,才能說打通了!

據(jù)王宗安上述文章,AlphaFold從2017年開始研發(fā),到2024年1月與禮來(NYSE:LLY)等大藥企達成合作、獲得首付款實現(xiàn)商業(yè)化突破,耗時超過6年;而David Baker創(chuàng)立的Baker Lab從2003年左右就開始從事蛋白質(zhì)的設計研究。

“制藥需要長期主義,不管你用不用AI!蓖踝诎矊懙馈

(應受訪者要求,李春、蔡誠、陳朝、羅新為化名)

南方周末特約撰稿 靳藍

責編 馮葉

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